平成2年度（1990）
開館記念特別展『北の色・形・文様』（平成3年2月17日〜3月24日）
平成3年度（1991）
第2回特別展『シベリアのトナカイ遊牧民ネネツ展』（平成3年7月21日〜8月24日）
第3回特別展『アイヌ文化にみる猟と漁』（平成4年2月8日〜3月15日）
平成4年度（1992）
第4回特別展『サハリン先住民の精神世界』（平成4年7月21日〜8月23日）
第5回特別展『マヤ：歴史と民族の十字路』（平成5年2月9日〜3月21日）
平成5年度（1993）
第6回特別展『北緯55度・アラスカ半島の先史文化』（平成5年4月27日〜6月3日）
国際先住民年記念特別展『北方諸民族と現代の民族芸術』（平成5年7月20日〜9月19日）
企画展『オホーツク文化・調査最前線』（平成5年11月2日〜11月14日）
第7回特別展『鳥居龍蔵のみた北方民族』（平成6年2月1日〜3月8日）
平成6年度（1994）
新収蔵資料展（平成6年4月26日〜5月17日）
第8回特別展『あそび・ゲーム・おもちゃ』（平成6年7月26日〜8月28日）
第9回特別展『北方民族の船：北の海をすすめ』（平成7年2月7日〜3月14日）
平成7年度（1995）
新収蔵資料展2“Northern Collection”（平成7年4月25日〜5月21日）
第10回特別展『大河アムールの民・ナーナイ：アムール民族芸術館所蔵資料展』（平成7年7月1日〜9月16日）
開館5周年記念移動展『Northern Peoples 北方地域にくらす諸民族』（平成7年10月4日〜10月10日）※会場はかでる２．７（道民活動センタービル）１階展示ホール
開館5周年記念企画展『Northern Peoples 北方地域にくらす諸民族』（平成8年2月6日〜3月24日）
平成8年度（1996）
第11回特別展『たばこと民族文化：たばこが北方に伝わるまで』（平成8年7月13日〜9月22日）
企画展『作ってみよう 入ってみよう 北のすまい』（平成9年2月4日〜3月16日）
平成9年度（1997）
第12回特別展『樺太1905-45：日本領時代の少数民族』（平成9年7月19日〜9月28日）
企画展『グリーンランド：地球のてっぺんの大きな島』（平成10年2月3日〜3月22日）
平成10年度（1998）
第13回特別展『人、イヌと歩く：イヌをめぐる民族誌』（平成10年7月19日〜9月27日）
ミニ北方文化展（平成10年11月7日） ※会場は道立オホーツク公園センターハウス
企画展『チベットの人と文化』（平成11年2月2日〜3月20日）
平成11年度（1999）
ロビー展『ウイルタの手仕事』（平成11年6月8日〜7月7日）
第14回特別展『神の魚・サケ：北方民族と日本』（平成11年7月20日〜9月26日）
企画展『北の海と川のめぐみ：縄文文化からアイヌ文化まで』（平成12年2月1日〜3月20日）
平成12年度（2000）
企画展『木彫り『熊』源流展』（平成12年6月6日〜7月2日） ※主催：木彫り「熊」源流展実行委員会、共催北海道立北方民族博物館
第15回特別展『トーテムポールとサケの人びと：北西海岸インディアンの森と海の世界』（平成12年7月18日〜9月24日）
開館10周年記念企画展『グレートジャーニー 北をめざした人類の子孫たち』（平成13年1月10日〜3月25日）
平成13年度（2001）
第16回特別展『美しき北の文様 the brilliant northern design』（平成13年7月19日〜9月26日）
企画展 『北の古代世界：擦文文化の頃』（平成14年2月5日〜3月22日）
平成14年度（2002）
第17回特別展『狩る：北の地に獣を追え』（平成14年7月19日〜9月26日）
写真展『渡鴉のアーチ』（平成14年11月1日〜11月14日）
企画展『毛皮：身をまもる技と心』（平成15年2月4日〜3月23日）
平成15年度（2003）
ロビー展『ミュージアムコレクション：モンゴルの生活と馬具』（平成15年4月26日〜5月18日）
第18回特別展『先住民社会と水産資源：サケ・海獣・ナマコ』（平成15年7月19日〜9月28日）
ロビー展『発掘速報展』（平成15年10月4日〜10月19日）
企画展『セドナの箱：オーロラの下のシャマンと民話の世界から』（平成16年2月7日〜3月28日）
平成16年度（2004）
岩崎昌子コレクション「カナダからやってきたイヌイットの壁掛け展」平成16年4月29日〜5月16日
ロビー展 『収蔵資料展』（平成16年6月１日〜7月4日）
第19回特別展 『北の遊牧民 −モンゴルからシベリアへ−』（平成16年7月17日〜9月26日）
ロビー展 『北の展示を彩るポスター＆カタログ展』（平成16年11月1日〜11月28日）
企画展 『アラスカ遠征のパイオニア・明治大学アラスカコレクション』（平成17年2月5日〜3月27日）
平成17年度（2005） 
詳細
ロビー展 『ミュージアム・コレクション「北のお人形」』（平成17年4月28日〜5月29日）
ロビー展 『自然への畏敬−清水晶子・植物画展』（平成17年6月17日〜7月3日）
第20回特別展 『アイヌと北の植物民族学 〜たべる・のむ・うむ〜』（平成17年7月16日〜10月10日）
森下造形研究室作品展 『素敵な革工芸』（森下造形研究室主催） （平成17年10月21日〜10月30日）
ロビー展 『ミュージアム・コレクション「北の楽器展』（平成17年11月3日〜12月4日）
企画展 『イヌイト・アートの世界 〜光洋マテリカ寄贈資料展〜』（平成18年2月4日〜3月26日）
平成18年度（2006） 詳細
ロビー展 『北方の船』 （平成18年4月8日〜4月23日）
ロビー展 『西村幹也写真展』 （平成18年4月28日〜6月25日）
第21回特別展 『環北太平洋の文化１ コリヤーク：ツンドラの開拓者たち』（平成17年6月17日〜7月3日）
企画展 『原ひろ子コレクション展』 （平成18年10月21日〜12月10日）
企画展 『北の台所事情 〜食にまつわる道具類』 （平成19年2月3日〜3月25日）
平成19年度(2007) 詳細
企画展・北海道開拓記念館2007移動博物館 『カナディアン・ロッキーと大平原のくに：アルバータにいきづく多文化』 （平成19年4月28日［土］〜6月26日［火］）
第22回特別展 『環北太平洋の文化2 世界で一番ダイナミックな海 ベーリング海に生きる人びと 舞台は極北のベーリング海 自然も文化も歴史もひとめぐり チュクチもエスキモーもアリュートも 日本人も大活躍』（平成19年7月14日［土］〜10月8日[月]）
ロビー展 『サハ共和国の自然と文化』 （平成19年10月19日[金]〜12月16日[日]）
『オホーツクブルー展』（平成20年1月10日[木]−1月17日[木]）
企画展 『森の人ウデヘ：ウスリータイガに暮らす』 （平成20年2月2日[土]〜3月23日[日]）
平成20年度(2008) 詳細
写真展『こんにちはモンゴル〜海外協力隊員が見たモンゴルの今』（平成20年4月5日［土］〜4月20日日）
ロビー展『大昔の大きな動物：サハのマンモスを知ろう！』（平成20年4月26日［土］〜6月25日［水］）
ロビー展『みんなが描いたマンモス展』（平成20年5月5日［月］〜6月25日［水］）
第23回特別展 『環北太平洋の文化3 トーテムの物語〜北西海岸インディアンのくらしと美』（平成20年7月19日［土］〜10月19日[日]）
